处理航拍三维实景建模中的阴影和反光问题，可以采用以下几种方法：

调整拍摄时间：选择合适的时间进行拍摄，避免在中午太阳高度角较高时进行拍摄。早晨和黄昏时分，太阳角度较低，光线柔和，可以减少阴影和反光问题。

调整飞行高度：飞行高度也会影响阴影和反光问题。适当降低飞行高度，可以增加拍摄的细节，但同时也会增加拍摄难度和数据处理量。需要根据实际情况选择合适的飞行高度。

使用滤镜或遮光板：在相机镜头前加装滤镜或使用遮光板可以减少反光问题。一些滤镜可以吸收多余的光线，减少反光，而遮光板则可以遮挡不必要的反射光。

后期处理：在数据处理阶段，可以使用图像处理软件对阴影和反光问题进行修复。通过调整亮度、对比度、色彩等参数，可以改善图像质量，减少阴影和反光。

建立阴影数据库：对于复杂的阴影问题，可以建立阴影数据库，对不同时间、不同角度、不同光照条件下的阴影进行记录和存储。在建模过程中，可以利用阴影数据库对阴影进行修正，提高建模的精度和准确性。

综上所述，处理航拍三维实景建模中的阴影和反光问题需要综合考虑拍摄时间、飞行高度、滤镜或遮光板的使用、后期处理以及阴影数据库的建立等多种方法和技巧。通过综合应用这些方法和技术，可以有效地减少阴影和反光问题，提高建模的精度和准确性，为数字孪生城市建设和相关领域提供更加可靠的技术支持。

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